Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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