Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SNTB2Q13425 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTB2Q13425 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms