Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSLNQ13421 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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