Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
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