Protein–RNA interactions for Protein: Q13349

ITGAD, Integrin alpha-D, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGADQ13349 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ITGADQ13349 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGADQ13349 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms