Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMQ13315 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATMQ13315 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATMQ13315 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATMQ13315 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATMQ13315 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATMQ13315 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATMQ13315 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATMQ13315 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATMQ13315 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATMQ13315 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATMQ13315 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATMQ13315 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATMQ13315 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATMQ13315 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATMQ13315 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATMQ13315 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATMQ13315 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATMQ13315 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATMQ13315 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATMQ13315 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATMQ13315 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATMQ13315 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATMQ13315 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATMQ13315 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATMQ13315 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATMQ13315 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATMQ13315 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
ATMQ13315 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATMQ13315 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATMQ13315 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATMQ13315 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
ATMQ13315 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATMQ13315 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATMQ13315 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATMQ13315 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATMQ13315 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATMQ13315 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
ATMQ13315 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATMQ13315 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATMQ13315 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATMQ13315 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATMQ13315 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATMQ13315 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ATMQ13315 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATMQ13315 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATMQ13315 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATMQ13315 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATMQ13315 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATMQ13315 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ATMQ13315 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATMQ13315 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATMQ13315 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATMQ13315 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATMQ13315 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ATMQ13315 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATMQ13315 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATMQ13315 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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