Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RIGQ13278 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RIGQ13278 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RIGQ13278 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RIGQ13278 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RIGQ13278 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RIGQ13278 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RIGQ13278 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RIGQ13278 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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