Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.053e-9■■■□□ 18.3
TARDBPQ13148 TAF1-207ENST00000461764 1841 ntTSL 511.42□□□□□ -0.583e-8■■■□□ 18.3
TARDBPQ13148 TAF1-218ENST00000485087 1738 ntTSL 511.04□□□□□ -0.643e-8■■■□□ 18.3
TARDBPQ13148 TAF1-211ENST00000468167 1767 ntTSL 510.37□□□□□ -0.753e-8■■■□□ 18.3
TARDBPQ13148 TAF1-208ENST00000462588 1826 ntTSL 1 (best)9.41□□□□□ -0.93e-8■■■□□ 18.3
TARDBPQ13148 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.568e-7■■■□□ 18.3
TARDBPQ13148 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.068e-7■■■□□ 18.3
TARDBPQ13148 DAP-203ENST00000508253 785 ntTSL 215.17■□□□□ 0.028e-7■■■□□ 18.3
TARDBPQ13148 DAP-206ENST00000514882 562 ntTSL 410.07□□□□□ -0.88e-7■■■□□ 18.3
TARDBPQ13148 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.33e-20■■■□□ 18.3
TARDBPQ13148 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.621e-8■■■□□ 18.3
TARDBPQ13148 NFYB-201ENST00000240055 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.582e-12■■■□□ 18.3
TARDBPQ13148 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.87e-7■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 FNDC3B-207ENST00000469491 2916 ntTSL 215.93■□□□□ 0.142e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 FNDC3B-202ENST00000415807 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.622e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 FNDC3B-201ENST00000336824 7904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.992e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 FNDC3B-203ENST00000416957 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.052e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 FAM126B-205ENST00000453765 536 ntTSL 416.91■□□□□ 0.32e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 FAM126B-208ENST00000485636 530 ntTSL 416.46■□□□□ 0.232e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 FAM126B-203ENST00000446678 522 ntTSL 314.56□□□□□ -0.082e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 FAM126B-206ENST00000474118 771 ntTSL 313.19□□□□□ -0.32e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 FAM126B-211ENST00000498780 2209 ntTSL 28.01□□□□□ -1.132e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 FAM126B-204ENST00000452799 692 ntTSL 36.4□□□□□ -1.382e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 EHMT1-219ENST00000626066 1297 ntTSL 516.82■□□□□ 0.281e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 EHMT1-250ENST00000637977 2167 ntTSL 514.82□□□□□ -0.041e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 EHMT1-251ENST00000638071 1710 ntTSL 514□□□□□ -0.171e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.181e-11■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 STAT5A-209ENST00000588868 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.521e-11■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 SRPK2-212ENST00000482897 715 ntTSL 521.26■□□□□ 0.992e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 SRPK2-211ENST00000482862 329 ntTSL 521.14■□□□□ 0.972e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 SRPK2-206ENST00000465112 568 ntTSL 314.4□□□□□ -0.12e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 SRPK2-203ENST00000460391 666 ntTSL 213.85□□□□□ -0.192e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 SRPK2-204ENST00000462282 505 ntTSL 312.23□□□□□ -0.452e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 ST6GAL1-222ENST00000487031 592 ntTSL 419.99■□□□□ 0.792e-13■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 ST6GAL1-217ENST00000463542 516 ntTSL 419.65■□□□□ 0.742e-13■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 ST6GAL1-219ENST00000468614 642 ntTSL 211.43□□□□□ -0.582e-13■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 BMS1P1-202ENST00000580094 4294 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -19e-9■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 CDK16-216ENST00000520893 943 ntTSL 520.16■□□□□ 0.826e-8■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 CDK16-208ENST00000517426 1574 ntTSL 519.18■□□□□ 0.666e-8■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 CDK16-217ENST00000522234 1679 ntTSL 219.17■□□□□ 0.666e-8■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 CDK16-213ENST00000519758 991 ntTSL 317.18■□□□□ 0.346e-8■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.296e-8■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.126e-8■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 CDK16-215ENST00000520295 573 ntTSL 415.4■□□□□ 0.066e-8■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 CDK16-209ENST00000517479 520 ntTSL 414.66□□□□□ -0.066e-8■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 CDK16-218ENST00000522883 601 ntTSL 413.58□□□□□ -0.246e-8■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 CDK16-210ENST00000517997 562 ntTSL 413.01□□□□□ -0.336e-8■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 CDK16-204ENST00000457458 3158 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.586e-8■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.558e-7■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.598e-7■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 CABIN1-204ENST00000405822 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.628e-7■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.698e-7■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 KCTD10-202ENST00000440541 2493 ntTSL 217.11■□□□□ 0.332e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.13e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.162e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 KCTD10-216ENST00000545759 5355 ntTSL 1 (best)12.52□□□□□ -0.412e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.412e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 AGK-201ENST00000355413 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.563e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 AGK-209ENST00000496273 491 ntTSL 39.82□□□□□ -0.843e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 AGK-203ENST00000473247 1550 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.913e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 AGK-204ENST00000473884 568 ntTSL 57.65□□□□□ -1.183e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 AGK-207ENST00000494688 951 ntTSL 56.91□□□□□ -1.33e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 AGK-202ENST00000465241 988 ntTSL 25.95□□□□□ -1.463e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 DCAF1-202ENST00000423656 5946 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.961e-7■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 DCAF1-203ENST00000504652 5951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.031e-7■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 ARHGEF2-217ENST00000497907 764 ntTSL 319.63■□□□□ 0.732e-12■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 ARHGEF2-216ENST00000495070 571 ntTSL 416.94■□□□□ 0.32e-12■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 ARHGEF2-213ENST00000476273 668 ntTSL 314.06□□□□□ -0.162e-12■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.322e-12■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.392e-12■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 ARHGEF2-203ENST00000361247 4149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.462e-12■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 ARHGEF2-202ENST00000313695 4080 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.62e-12■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 ARHGEF2-211ENST00000471589 892 ntTSL 511.11□□□□□ -0.632e-12■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 ARHGEF2-207ENST00000465079 693 ntTSL 210.58□□□□□ -0.722e-12■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 ARHGEF2-214ENST00000477754 883 ntTSL 56.01□□□□□ -1.452e-12■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 USP6NL-201ENST00000277575 4512 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.652e-7■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.62e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 MEF2D-205ENST00000475587 1627 ntTSL 518.1■□□□□ 0.492e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 MEF2D-202ENST00000360595 3194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.632e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.173e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.443e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 SCAF8-202ENST00000367186 4908 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.763e-6■■■□□ 18.2
TARDBPQ13148 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.762e-6■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 MAP7D1-205ENST00000429533 959 ntTSL 317.72■□□□□ 0.432e-6■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 MAP7D1-207ENST00000474796 906 ntTSL 215.92■□□□□ 0.142e-6■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.032e-6■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 02e-6■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.888e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 ZNF148-204ENST00000471196 566 ntTSL 419.23■□□□□ 0.678e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.388e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.48e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 ZNF148-207ENST00000492394 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.798e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.278e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 GRB10-217ENST00000473696 1065 ntTSL 414.89□□□□□ -0.039e-10■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 GRB10-213ENST00000461886 624 ntTSL 29.13□□□□□ -0.959e-10■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.12e-9■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 ZFAND6-203ENST00000557983 2594 ntTSL 24.62□□□□□ -1.671e-6■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 WDR33-205ENST00000436787 822 ntTSL 514.22□□□□□ -0.134e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.164e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 WDR33-202ENST00000393006 3574 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.784e-7■■■□□ 18.1
Retrieved 100 of 14,326 protein–RNA pairs in 248.9 ms