Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RESTQ13127 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RESTQ13127 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RESTQ13127 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RESTQ13127 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RESTQ13127 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RESTQ13127 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RESTQ13127 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RESTQ13127 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RESTQ13127 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RESTQ13127 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RESTQ13127 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RESTQ13127 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RESTQ13127 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RESTQ13127 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RESTQ13127 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RESTQ13127 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RESTQ13127 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RESTQ13127 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RESTQ13127 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RESTQ13127 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RESTQ13127 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RESTQ13127 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RESTQ13127 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RESTQ13127 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RESTQ13127 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RESTQ13127 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RESTQ13127 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RESTQ13127 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RESTQ13127 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RESTQ13127 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RESTQ13127 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RESTQ13127 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RESTQ13127 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RESTQ13127 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RESTQ13127 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RESTQ13127 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RESTQ13127 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RESTQ13127 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RESTQ13127 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RESTQ13127 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RESTQ13127 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RESTQ13127 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RESTQ13127 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RESTQ13127 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RESTQ13127 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RESTQ13127 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RESTQ13127 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RESTQ13127 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RESTQ13127 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RESTQ13127 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RESTQ13127 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RESTQ13127 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RESTQ13127 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RESTQ13127 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RESTQ13127 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RESTQ13127 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RESTQ13127 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RESTQ13127 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RESTQ13127 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RESTQ13127 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RESTQ13127 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RESTQ13127 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RESTQ13127 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RESTQ13127 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RESTQ13127 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RESTQ13127 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RESTQ13127 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
RESTQ13127 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RESTQ13127 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RESTQ13127 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RESTQ13127 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RESTQ13127 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RESTQ13127 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RESTQ13127 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RESTQ13127 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RESTQ13127 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RESTQ13127 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RESTQ13127 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RESTQ13127 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RESTQ13127 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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RESTQ13127 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RESTQ13127 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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