Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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