Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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TRIM32Q13049 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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TRIM32Q13049 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
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TRIM32Q13049 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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TRIM32Q13049 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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TRIM32Q13049 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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TRIM32Q13049 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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TRIM32Q13049 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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TRIM32Q13049 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TRIM32Q13049 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM32Q13049 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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