Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
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GRIN2AQ12879 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
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GRIN2AQ12879 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
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GRIN2AQ12879 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
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GRIN2AQ12879 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
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GRIN2AQ12879 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
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GRIN2AQ12879 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
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GRIN2AQ12879 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
GRIN2AQ12879 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
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