Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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GTF3C1Q12789 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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GTF3C1Q12789 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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GTF3C1Q12789 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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GTF3C1Q12789 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
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GTF3C1Q12789 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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GTF3C1Q12789 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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GTF3C1Q12789 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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GTF3C1Q12789 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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GTF3C1Q12789 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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GTF3C1Q12789 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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