Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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