Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBRQ0VD83 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms