Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms