Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms