Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBBP4Q09028 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms