Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNDQ07001 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms