Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms