Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNG1Q06432 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms