Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms