Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms