Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A2Q05940 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms