Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNB3Q05901 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms