Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALD1Q05682 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms