Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIN1Q05586 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms