Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF85Q03923 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF85Q03923 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms