Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BDH1Q02338 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms