Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
OTUD4Q01804 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms