Protein–RNA interactions for Protein: Q01415

GALK2, N-acetylgalactosamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALK2Q01415 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GALK2Q01415 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GALK2Q01415 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GALK2Q01415 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GALK2Q01415 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GALK2Q01415 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GALK2Q01415 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GALK2Q01415 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GALK2Q01415 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GALK2Q01415 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALK2Q01415 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALK2Q01415 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALK2Q01415 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALK2Q01415 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALK2Q01415 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALK2Q01415 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALK2Q01415 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALK2Q01415 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALK2Q01415 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALK2Q01415 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALK2Q01415 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALK2Q01415 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GALK2Q01415 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms