Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPTBN1Q01082 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms