Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLTCQ00610 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLTCQ00610 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms