Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PIP4K2BP78356 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PIP4K2BP78356 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms