Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA52P62987 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA52P62987 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA52P62987 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA52P62987 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA52P62987 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA52P62987 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA52P62987 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA52P62987 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms