Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms