Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF3P57682 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF3P57682 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF3P57682 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF3P57682 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms