Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRG3P56975 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRG3P56975 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRG3P56975 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRG3P56975 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRG3P56975 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRG3P56975 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRG3P56975 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG3P56975 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG3P56975 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG3P56975 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG3P56975 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG3P56975 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG3P56975 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG3P56975 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG3P56975 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG3P56975 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG3P56975 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG3P56975 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG3P56975 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG3P56975 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG3P56975 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG3P56975 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG3P56975 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG3P56975 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG3P56975 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG3P56975 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG3P56975 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG3P56975 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG3P56975 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG3P56975 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG3P56975 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms