Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms