Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGDP52209 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PGDP52209 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGDP52209 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGDP52209 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGDP52209 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGDP52209 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGDP52209 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGDP52209 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PGDP52209 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGDP52209 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGDP52209 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGDP52209 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGDP52209 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGDP52209 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGDP52209 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGDP52209 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGDP52209 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGDP52209 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGDP52209 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGDP52209 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms