Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSR4P51571 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSR4P51571 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSR4P51571 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR4P51571 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR4P51571 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR4P51571 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR4P51571 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR4P51571 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR4P51571 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR4P51571 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR4P51571 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR4P51571 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms