Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IDH3AP50213 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IDH3AP50213 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms