Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms