Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5OP48047 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms