Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms