Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ACADSBP45954 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms