Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCAMP43121 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCAMP43121 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCAMP43121 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCAMP43121 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCAMP43121 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCAMP43121 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCAMP43121 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MCAMP43121 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCAMP43121 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCAMP43121 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCAMP43121 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MCAMP43121 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCAMP43121 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCAMP43121 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCAMP43121 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCAMP43121 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCAMP43121 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCAMP43121 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCAMP43121 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCAMP43121 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCAMP43121 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCAMP43121 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCAMP43121 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCAMP43121 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCAMP43121 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms