Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FDFT1P37268 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms