Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms