Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA7P36544 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms